16 декабря на портале препринтов bioRxiv было опубликовано исследование, предоставляющее самые ранние молекулярные доказательства существования вируса папилломы человека (ВПЧ) у людей современного типа. Ученые обнаружили ДНК штамма HPV16, а именно линии HPV16A, в останках двух древних людей. Этот тип вируса классифицируется как онкогенный и способен провоцировать развитие рака. На данный момент работа, описывающая открытие, еще не прошла процедуру рецензирования.
Первым объектом генетического анализа стал Эци, известный как «ледяной человек». Его естественно мумифицированное тело, прекрасно сохранившееся вместе с одеждой и инструментами, было найдено в 1991 году высоко в горной цепи Альп на австро-итальянской границе. Возраст находки составляет 5300 лет.
Вторым исследованным индивидом стал так называемый человек из Усть-Ишима, живший приблизительно 45 000 лет назад. Его останки, представляющие собой одну бедренную кость, были обнаружены в 2008 году в Западной Сибири. Несмотря на фрагментарность костного материала, он позволил получить один из старейших полностью секвенированных геномов современного человека.
Исследовательскую группу возглавил Марсело Брионес, профессор Центра медицинской биоинформатики Медицинской школы Федерального университета Сан-Паулу в Бразилии. Команда не проводила новых раскопок, а переанализировала уже имеющиеся в открытом доступе наборы данных секвенирования геномов. В ходе поиска генетических фрагментов, совпадающих с известными геномами ВПЧ, ученые выявили множественные совпадения с HPV16A как у Эци, так и у человека из Усть-Ишима.
До этого открытия доминировала гипотеза, что вирус передался людям от неандертальцев в результате скрещивания. Известно, что эти два вида пересекались на территории Евразии в период от 60 000 до 34 000 лет назад, что и считалось вероятным временным окном для передачи патогена.
Результаты работы группы Брионеса ставят под сомнение теорию неандертальской передачи. Ученые предполагают, что HPV16 был ассоциирован с анатомически современными людьми задолго до основных миграций из Африки, то есть ранее 50 000–60 000 лет назад. Это подтверждает идею о том, что онкогенные вирусы папилломы являются давними спутниками приматов и людей, эволюционируя вместе с ними на протяжении длительного времени. Компьютерные модели и ранее указывали на коэволюцию папилломавирусов с позвоночными в течение сотен миллионов лет, но данное исследование дает первое прямое биологическое подтверждение этому факту на примере древних людей.
Независимую оценку работе дал Кунраад Ван Дорслаер, временный сопредседатель факультета иммунобиологии Университета Аризоны, не участвовавший в исследовании. Он «в значительной степени» согласился с выводами, отметив, что авторы «строго продемонстрировали» наличие инфекции у обоих индивидов. Эксперт выразил энтузиазм по поводу того, что данные поддерживают критически важные предположения об истории этого семейства вирусов.
Тем не менее, Ван Дорслаер счел утверждение о полном опровержении неандертальской теории «возможно, преувеличенным». Аргументация эксперта строится на том, что геном человека из Усть-Ишима уже содержал неандертальскую ДНК. Это доказывает факт межвидового скрещивания до его рождения, следовательно, наличие HPV16 в его организме не исключает возможности получения вируса именно в результате предшествующего контакта предков с неандертальцами.
Авторы признают ограничения исследования, связанные с крайне малым размером выборки, состоящей всего из двух индивидов, и сложностью точного определения географического места происхождения HPV16. Сам вирус в современном мире распространен широко, передается при прямом контакте кожа-к-коже или половым путем и в большинстве случаев не вызывает симптомов, хотя небольшая часть штаммов несет высокий риск развития рака.
Изображение носит иллюстративный характер
Первым объектом генетического анализа стал Эци, известный как «ледяной человек». Его естественно мумифицированное тело, прекрасно сохранившееся вместе с одеждой и инструментами, было найдено в 1991 году высоко в горной цепи Альп на австро-итальянской границе. Возраст находки составляет 5300 лет.
Вторым исследованным индивидом стал так называемый человек из Усть-Ишима, живший приблизительно 45 000 лет назад. Его останки, представляющие собой одну бедренную кость, были обнаружены в 2008 году в Западной Сибири. Несмотря на фрагментарность костного материала, он позволил получить один из старейших полностью секвенированных геномов современного человека.
Исследовательскую группу возглавил Марсело Брионес, профессор Центра медицинской биоинформатики Медицинской школы Федерального университета Сан-Паулу в Бразилии. Команда не проводила новых раскопок, а переанализировала уже имеющиеся в открытом доступе наборы данных секвенирования геномов. В ходе поиска генетических фрагментов, совпадающих с известными геномами ВПЧ, ученые выявили множественные совпадения с HPV16A как у Эци, так и у человека из Усть-Ишима.
До этого открытия доминировала гипотеза, что вирус передался людям от неандертальцев в результате скрещивания. Известно, что эти два вида пересекались на территории Евразии в период от 60 000 до 34 000 лет назад, что и считалось вероятным временным окном для передачи патогена.
Результаты работы группы Брионеса ставят под сомнение теорию неандертальской передачи. Ученые предполагают, что HPV16 был ассоциирован с анатомически современными людьми задолго до основных миграций из Африки, то есть ранее 50 000–60 000 лет назад. Это подтверждает идею о том, что онкогенные вирусы папилломы являются давними спутниками приматов и людей, эволюционируя вместе с ними на протяжении длительного времени. Компьютерные модели и ранее указывали на коэволюцию папилломавирусов с позвоночными в течение сотен миллионов лет, но данное исследование дает первое прямое биологическое подтверждение этому факту на примере древних людей.
Независимую оценку работе дал Кунраад Ван Дорслаер, временный сопредседатель факультета иммунобиологии Университета Аризоны, не участвовавший в исследовании. Он «в значительной степени» согласился с выводами, отметив, что авторы «строго продемонстрировали» наличие инфекции у обоих индивидов. Эксперт выразил энтузиазм по поводу того, что данные поддерживают критически важные предположения об истории этого семейства вирусов.
Тем не менее, Ван Дорслаер счел утверждение о полном опровержении неандертальской теории «возможно, преувеличенным». Аргументация эксперта строится на том, что геном человека из Усть-Ишима уже содержал неандертальскую ДНК. Это доказывает факт межвидового скрещивания до его рождения, следовательно, наличие HPV16 в его организме не исключает возможности получения вируса именно в результате предшествующего контакта предков с неандертальцами.
Авторы признают ограничения исследования, связанные с крайне малым размером выборки, состоящей всего из двух индивидов, и сложностью точного определения географического места происхождения HPV16. Сам вирус в современном мире распространен широко, передается при прямом контакте кожа-к-коже или половым путем и в большинстве случаев не вызывает симптомов, хотя небольшая часть штаммов несет высокий риск развития рака.
